Opublikowanie artykułu przeglądowego w czasopiśmie o tak wysokiej renomie stanowi znaczący sukces naukowy młodego badacza i potwierdza wysoki poziom prowadzonych badań w jednostkach WUM. Współautorem pracy obok Tomasza Szostka jest dr hab. Daniel Szulczyk z Katedry i Zakładu Biochemii WL.
Na czym polega zjawisko activity cliffs
Artykuł pt. „From obstacle to design advantage: Activity cliff aware modeling for small-molecule drug discovery” podejmuje jedno z kluczowych i najbardziej aktualnych zagadnień współczesnego odkrywania leków - wykorzystanie zjawiska tzw. activity cliffs w modelowaniu zależności struktura-aktywność dla substancji czynnych.
Activity cliffs to zjawiska, w których bardzo niewielkie zmiany strukturalne pomiędzy bardzo podobnymi cząsteczkami chemicznymi prowadzą do nieproporcjonalnie dużych różnic w aktywności biologicznej. Ujawniają one nieliniowość i nieciągłości relacji struktura–aktywność, obalając klasyczne założenie „podobna struktura – podobna aktywność”. Z tego powodu "activity cliffs" stanowią jednocześnie istotne wyzwanie dla modeli predykcyjnych (przewidujących) i cenne źródło wiedzy wspierające racjonalne projektowanie związków in silico (czyli za pomocą programów komputerowych).
Co nowego wnosi artykuł naszych naukowców
Praca naukowców z WUM redefiniuje dotychczasowe podejście do activity cliffs, które tradycyjnie uznawano za problem utrudniający przewidywanie aktywności biologicznej związków. Autorzy pokazują, że zjawisko to może stać się świadomie wykorzystywaną przewagą projektową, szczególnie w kontekście nowoczesnych metod chemoinformatycznych oraz sztucznej inteligencji stosowanej w projektowaniu małocząsteczkowych kandydatów na leki. Tematyka ta doskonale wpisuje się w aktualne światowe trendy badawcze na styku biologii molekularnej, chemii obliczeniowej i AI.
O Drug Discovery Today
Drug Discovery Today (Impact Factor 7.5, CiteScore 16.0) należy do czołowych czasopism w obszarze odkrywania i rozwoju leków, publikując prace o dużym wpływie naukowym, szeroko cytowane i skierowane do międzynarodowego grona badaczy oraz przedstawicieli przemysłu farmaceutycznego. Publikacja w tym tytule podkreśla jakość, aktualność i znaczenie zaprezentowanych badań.
Strona ScienceDirect, gdzie zamieszczony jest cały artykuł