Computational pathway analysis and simulation in cancer

Alfredo Ferro

Professor of Computer Science
Department of Clinical and Experimental Medicine
University of Catania

The key role of microRNAs and other ncRNAs in many biological processes, functions and diseases has been widely demonstrated. Their diagnostic and therapeutic potential is being exploited as one of the most promising directions. Bioinformatics and in-silico analysis are playing a key role in this context. In this talk we survey a novel series of techniques developed by our group to improve this methodology by computing “perturbation” of pathways and their endpoints using a topology-based approach. Starting from gene/microRNA expressions (coming from NGS or other techniques) our algorithms are able to produce the list of most perturbed pathways corresponding to a given phenotype. Furthermore, our tools are able to extract the local areas of biological pathways which might represent more accurately the biology underlying a patient condition or a specific phenotype. Finally, the same algorithms can be used to simulate the alteration of a set of molecules in a given organism. Application to cancer biology will be illustrated. Finally a synthetic biology technique to design target-specific artificial microRNA will be mentioned.

Summer School Of Global Health realizowana jest w ramach Projektu „WUM AID Akademia Innowacyjnej Dydaktyki Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego”

Informacje na stronie 
Zgłoszenia na stronie 
Program

Zajęcia zaplanowane przez Wydział Nauki o Zdrowiu w ramach XXIII Festiwalu Nauki 2019

23.09 „Od poczęcia do narodzin – pomoc człowiekowi w przyjściu na świat” - dr n. med. Grażyna Bączek, Studenckie Naukowe Koło Położnych godz. 16:00, ul. Litewska 14/ 16

24.09  Evidence-based medicine (EBM), czyli po co nam dowody naukowe w medycynie? - dr hab. Mariusz Panczyk, Zakład Dydaktyki i Efektów Kształcenia, godz. 16:30, Centrum Biblioteczno-Informacyjne WUM, ul. Żwirki i Wigury  63

25.09 Czy szczęście może być ukryte w żywności? -  dr n. o zdr Mariusz Jaworski, Zakład Dydaktyki i Efektów Kształcenia, godz. 16:00, Centrum Biblioteczno-Informacyjne WUM, ul. Żwirki i Wigury  63

26.09 Druga szansa, czyli życie po przeszczepieniu nerki; dr n. o zdr. Zofia Sienkiewicz, dr n. o zdr. Ewa Kobos, dr n. o zdr. Anna Leńczuk-Gruba, dr n. o zdr. Marta Hreńczuk oraz pacjentka po przeszczepieniu nerki, dr hab.,n, med. Łukasz Czyżewski, Magdalena Andrzejczak, Maria Ciok, Kamila Czernicka, Aleksandra Gębska, Aneta Szopa, Aneta Tyjeńska, Zakład Pielęgniarstwa Społecznego, godz. 15.00, Zakład Pielęgniarstwa Społecznego, ul. Erazma Ciołka 27

 27.09 Bank mleka? Mleczna lokata w zdrowie! - dr n biol Aleksandra Wesołowska, Uniwersytecka Pracownia Badań nad Mlekiem Kobiecym i Laktacją przy Regionalnym Banku Mleka w Szpitalu. im. św. Rodziny w Warszawie, Klinika Neonatologii, WNOZ, godz. 18:00, ul. Madalińskiego 25, Warszawa

Strona Festiwalu http://festiwalnauki.edu.pl/