Najwyższym organem kolegialnym uczelni jest Senat, któremu przewodniczy Rektor. Senat podejmuje uchwały wiążące wszystkie organy uczelni, a także wszystkich jej pracowników i studentów, może również wyrażać opinie w imieniu całej społeczności akademickiej uczelni.
Najwyższą godność w szkole piastuje Rektor, który kieruje działalnością uczelni, reprezentuje ją na zewnątrz i jest zwierzchnikiem wszystkich pracowników oraz studentów i doktorantów.
Rektor podejmuje decyzje we wszystkich sprawach dotyczących uczelni, z wyjątkiem spraw zastrzeżonych przez ustawę lub Statut do kompetencji innych organów uczelni lub kanclerza.
W realizacji swoich zadań Rektor współpracuje z czterema zastępcami:
- Prorektorem ds. Dydaktyczno-Wychowawczych,
- Prorektorem ds. Nauki i Współpracy z Zagranicą,
- Prorektorem ds. Klinicznych, Inwestycji i Współpracy z Regionem,
- Prorektorem ds. Kadr.
Podstawową jednostką organizacyjną uczelni jest wydział, którego zadaniem jest tworzenie warunków do prowadzenia działalności naukowej i dydaktycznej oraz kształcenia kadry naukowej. Wydziałem kieruje dziekan, wspierany w realizacji swoich zadań przez prodziekanów.
Najwyższym organem kolegialnym wydziału jest rada wydziału, która jest odpowiedzialna za jakość życia akademickiego wydziału.
Podstawowymi jednostkami organizacyjnymi wydziału są instytuty, katedry, kliniki, zakłady oraz centra badawcze. Ponadto, w ramach wydziałów mogą być tworzone oddziały, którymi kierują prodziekani.